Сегодня РГПУ им.А.И.Герцена является крупнейшим вузом России. В его составе — более  20  факультетов и  100  кафедр, а также Институт довузовской подготовки, Институт повышения квалификации и переподготовки, НИИ непрерывного педагогического образования,  Институт естествознания,  Институт гуманитарного образования,  Межвузовский центр международного сотрудничества,  Международный центр образовательных инноваций, Центр дистанционного обучения и телекоммуникационной поддержки образования,  Лингвистический центр,  Центр технологий обучения,  Центр международного образования «Российские Исследования». Все образовательные структурные подразделения взаимодействуют с научными подразделениями университета:  НИИ физики,  НИИ непрерывного педагогического образования,  НИИ общего образования, более чем  25  научными центрами и лабораториями.

Интеграция образовательной и научно-инновационной деятельности осуществляется в  11  научно-образовательных центрах, объединенном междисциплинарном центре коллективного пользования ««Современные физико-химические методы формирования и исследования материалов для нужд промышленности, науки и образования»», малых инновационных предприятиях «Органика РГПУ», «Геоэкология окружающей среды», «Технология блеска».

Профессорско-преподавательский состав университета насчитывает более  1700  человек (основной штатный персонал), среди них около  260  докторов наук, более  850  кандидатов наук. В его стенах работают видные ученые — академики и члены-корреспонденты РАН и РАО, члены различных общественных и международных Академий, заслуженные деятели науки и культуры, народные и заслуженные артисты. 

В  1993  г. университет стал одним из первых вузов России, начавших эксперимент по введению многоуровневой системы высшего образования. Он готовит бакалавров и магистров по различным направлениям высшего педагогического образования и науки. Университет обучает специалистов по более чем  30  специальностям:

• география, биология, химия, краеведение, туризм (факультеты географии, биологии, химии);

• физика, информатика, астрономия, математика (факультеты физики, математики);

• русский язык и литература, русский язык как иностранный, английский, немецкий, французский, испанский и другие языки (филологический факультет, факультеты русского языка как иностранного, иностранных языков);

• история, социология, психология, педагогика, социальная педагогика, политология, экономика, юриспруденция, философия, культурология (факультеты социальных наук, экономики, философии человека, народов Крайнего Севера);

• педагогика и методика дошкольного и начального образования (факультеты дошкольного и начального образования);

• олигофренопедагогика, логопедия, тифлопедагогика, сурдопедагогика (факультет коррекционной педагогики);

• музыка, изобразительное и декоративно-прикладное искусство, мировая художественная культура (факультеты музыки, изобразительного искусства);

• физическая культура и спорт, безопасность жизнедеятельности, технология и предпринимательство (факультеты физической культуры, безопасности жизнедеятельности, технологии и предпринимательства).

Многие факультеты не имеют аналогов в России: факультеты народов Крайнего Севера, философии человека, повышения квалификации и профессиональной переподготовки работников образования, безопасности жизнедеятельности. На дневном, заочном и вечернем отделениях обучается около  20  тысяч студентов и аспирантов.

Сегодня университет поддерживает договорные отношения с  60  зарубежными университетами и различными образовательными учреждениями США, Англии, Австрии, Италии, Франции, Швейцарии, Германии, Нидерландов, Польши, Швеции, Финляндии, Китая, Кореи, Израиля, Японии и других стран.

Признание высокого международного статуса университета выразилось в открытии кафедры ЮНЕСКО, единственной в системе педагогических вузов, а также в создании в университете совместным решением Министерства образования России и Министерства образования, культуры и науки Нидерландов Международного центра образовательных инноваций. С  1  апреля  1995  г. в состав учредителей центра вошло Министерство науки, исследований и искусств Австрии.